Saturday , 25 May 2019
Home » DESAIN SINTESIS POLIMER TERCETAK MOLEKULAR BRAZILEIN DENGAN SIMULASI DINAMIKA MOLEKULAR
DESAIN SINTESIS POLIMER TERCETAK MOLEKULAR BRAZILEIN DENGAN SIMULASI DINAMIKA MOLEKULAR
DESAIN SINTESIS POLIMER TERCETAK MOLEKULAR BRAZILEIN DENGAN SIMULASI DINAMIKA MOLEKULAR

DESAIN SINTESIS POLIMER TERCETAK MOLEKULAR BRAZILEIN DENGAN SIMULASI DINAMIKA MOLEKULAR

DESAIN SINTESIS POLIMER TERCETAK MOLEKULAR BRAZILEIN DENGAN SIMULASI DINAMIKA MOLEKULAR

Faqih Abdurrahman1, Iqmal Tahir1, Mokhammad Fajar Pradipta1

1Departemen Kimia, Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam, Universitas Gadjah Mada, Jl. Sekip Utara BLS 21, Bulaksumur, Senolowo, Sinduadi, Mlati, Kabupaten Sleman, Daerah Istimewa Yogyakarta 55281

E-mail: faqih.abdurrahman@mail.ugm.ac.id

 

Abstrak: Penelitian ini mengenai rancangan sintesis polimer tercetak molekular brazilein dengan metode simulasi dinamika molekular. Tujuan penelitian ini adalah untuk mengetahui rasio optimum templat brazilein dengan monomer fungsional asam metakrilat serta mempelajari dinamika ikatan hidrogen yang terjadi selama proses sintesis. Kajian simulasi dinamika molekular menggunakan AMBER dengan pengolahan hasil simulasi menggunakan PTRAJ dan CPPTRAJ serta VMD. Rasio optimum ditentukan dari nilai persentase okupansi ikatan hidrogen situs aktif ikatan hidrogen sedangkan dinamika ikatan hidrogen diamati dari grafik ikatan hidrogen. Hasil penelitian merekomendasikan rasio untuk sintesis laboratorium sebesar 1:3 dengan persentase okupansi tertinggi sebesar 44,30% pada jarak 2,835 Å dan sudut ikat 32,05º.

 

Kata kunci:   brazilein, polimer tercetak molekular, simulasidinamikamolekular.

 

Abstract: This research was designe of molecular imprinted polymer of brazilein using molecular dynamic simulation. The purpose is to decide the optimum ratio of brazilein as template and methacrylic acid as functional monomer and to study the phenomenon of hydrogen bond that occured during simulation process. Study on simulation use AMBER and the result processing by PTRAJ, CPPTRAJ, and VMD.The optimum ratio determined by occupancy percentage of hydrogen bond while hydrogen bond dymanics observed by hydrogen bond graph.The recommended ratio was 1:3 with highest occupancy percentage was 44,30% at distance of 2,835 Å and bond angle of 32,05º

 

Key words:           brazilein, molecular dynamic simulation, molecularly imprinted polymer.

 

Download Artikel